生命科学データベース・ウェブツール

出版社: MEDSi
著者:
発行日: 2018-11-27
分野: 基礎・関連科学  >  生命科学
ISBN: 9784815701437
書籍・雑誌
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商品紹介

生命科学の研究者にとって、いまやマストなスキルとなったデータベースやウェブツール。ラボで役に立つ定番18ツールの使い方を徹底的にわかりやすく解説。 インターネットの動画サイト「統合TV」の編集部による責任編集。パソコンの操作手順をわかりやすく図解。さらに、動画でも確認できるように、「統合TV」の動画サイトリンクを表示。

目次

  • Part 1 生命科学系研究室の新人が絶対に知っておくべき5 つのツール
     1章 PubMed で論文を効率的に検索する
     2章 PowerPoint で欲しいイラストを描く
     3章 Google のサービスを活用する
     4章 BLAST で遺伝子の配列類似性検索をする
     5章 PCR プライマーを設計する- Primer3Plus とPrimer-BLAST

    Part 2 「 仮説・実験・解析・出版」の研究サイクルを加速させる便利なツール
     6 章 ImageJ で画像ファイルを操作する
     7 章 ゲノムブラウザを使って遺伝子を知る─ UCSC Genome Browser など
     8 章 英語表現や略語をすばやく検索する─ inMeXes とAllie
     9 章 最新知見を日本語で知る・読む・学ぶ─新着論文レビューと領域融合レビュー

    Part 3 生命科学系データ解析の現場で,押さえておきたい「鉄板」ツール
     10 章 MEGAで系統樹を作成する
     11 章 RefEx とChip-Atlas で公共の遺伝子発現データを快適に検索する
     12 章 Metascapeでエンリッチメント解析をして自分の持つ遺伝子リストを解釈する

    Part 4 ビッグデータ時代の疾患ゲノム解析で使いこなしたいデータベース
     13 章 TCGAで各がん種の公開データのダウンロードや解析を行う
     14 章 COSMIC でがん遺伝子の体細胞変異を調べる
     15 章 GWAS Catalog で形質とバリアントの関連について検索する
     16 章 ClinVar で疾患に関連するバリアントを検索する
     17 章 gnomAD でヒトのエキソームやゲノムのデータから変異を探す
     18 章 GTEx Portal でヒトの各組織での遺伝子発現量や影響するeQTL を調べる

    付録 動画作製の舞台裏

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