がんゲノムデータ解析

出版社: MEDSi
著者:
発行日: 2022-08-30
分野: 基礎・関連科学  >  生命科学
ISBN: 9784815730529
書籍・雑誌
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6,600 円(税込)

商品紹介

がんゲノム医療において不可欠な、がんゲノムのデータを解析する知識と技術が身につく、実践に即した解説書。各章とも「教科書パート」(教師役が執筆)でソフトウェアのインストールから解析データの取得、データ解析、そして結果の可視化までを学び、「再現・検証レポート」(生徒役が執筆)で実際に解析を体験。つまずいた箇所は「教科書パート」にフィードバックし再確認できる、初学者の独学に効果的な学習形式を採用。データ解析未経験者でもよくわかる必携書。

目次

  • 第1章 がんのゲノム・オミックス解析を視野に入れた検体保存方法
    COLUMN 1 がんゲノム研究と倫理的・法的・社会的課題

    第2章 がんのターゲットリシークエンス
       ―がんパネルシークエンスによる乳がん変異検出
    再現・検証 とある検査技師のブラックボックスへの挑戦録
    再現・検証 DRY解析初心者遺伝カウンセラーの挑戦
    特別寄稿 遺伝カウンセラーが「がん患者」になるとき
    COLUMN 2 がんゲノムプロファイリング検査におけるエキスパートパネルの概要と課題
    COLUMN 3 がん遺伝子パネル検査の課題 (1)医師の立場として
    COLUMN 4 がん遺伝子パネル検査の課題 (2)臨床検査会社として

    第3章 がんの融合遺伝子検出
       ―RNAシークエンスによるがん融合遺伝子検出
    再現・検証 Macか,Windowsか,それが問題だ

    第4章 がんのCNV検出
       ―SNPアレイによる転移性肝がん,およびメラノーマのコピー数変異検出
    再現・検証 中年も,大志を抱け―Linuxを扱うべきか扱わないべきかそれが問題だ

    第5章 がんのゲノム解析
       ―ロングリードシークエンサーによる肺がんゲノム構造変異検出
    再現・検証 遺伝子解析? それ美味しいの? 完全門外漢によるはじめての遺伝子解析
    COLUMN 5 完全ヒトゲノム配列ががんゲノム解析にもたらす恩恵

    第6章 がんのGWAS
       ―GWASによる乳がん感受性多型の検出
    再現・検証 世界で一番スマートなGWAS体験をあなたへ

    第7章 がんのポリジェニックリスクスコア
       ―ゲノムデータから乳がんリスクスコアを計算
    再現・検証 Mac初心者にもできる!できると楽しい!PRSの再現・検証
    COLUMN 6 がん環境要因の疫学研究と分子疫学

    第8章 がんのエピゲノム解析
       ―マイクロアレイによる腎がんエピゲノム変異検出
    再現・検証 R(ほぼ)初心者,EWASに挑戦
     ―驚愕!?メチル化データによる性別推定の有用性と謎

    第9章 がんのcfDNA解析
       ―リキッドバイオプシーによる大腸がん変異検出
    再現・検証 「血の一滴」はどれだけ「重い」―cfDNAで読みとく運命の行方
    COLUMN 7 がんワクチン臨床試験の統計学的課題

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