大規模ゲノム解析技術とポストシーケンス時代の遺伝子機能解析
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目次
- 大規模ゲノム解析技術とポストシーケンス時代の遺伝子機能解析
林崎良英 監修
−目次−
第1章 ライブラリー作成の技術
1.包括的完全長cDNAライブラリーの作成
2.ショットガンライブラリーの作成
3.BACライブラリーの作成
他
第2章 大規模シーケンスシステム
1.大規模シーケンスのための鋳型プラスミドの調整法
2.転写シーケンス法
3.大容量DNAマルチキャピラリーシーケンサーを用いた塩基配列解析
第3章 シーケンス分離理論とトラブルシューティング
1.DNAシーケンスにおける分離性能の評価Index(1)理論的背景
2.DNAシーケンスにおける分離性能の評価Index(2)ゲルの分離性能についての実例
3.シーケンスに関するトラブルとその対策
第4章 アセンブルとコンピュータシステム
1.ベースコールと精度Phred Quality Valueのチューニング
2.アセンブル
3.Phred/phrap/consed−アセンブルとエディティング
第5章 機能ゲノム科学
1.restriction landmark genomic scanning(RLGS)法
2.restriction landmark cDNA scanning(RLCS)法
3.完全長cDNAシーケンスの情報処理技術−コーディング領域・機能の予測